Een groot deel van zijn leven wijdt Simon van Gijn aan het verzamelen van prenten, tekeningen, aquarellen en foto’s: de Atlas Van Gijn. Hij brengt een verzameling bijeen met vele unieke en zeldzame prenten. Het zijn circa 35.000 stukken met afbeeldingen over de geschiedenis van Dordrecht en Nederland. Naast het verzamelen van prenten besteedt hij veel tijd aan het analyseren en beschrijven ervan. De prenten krijgt of koopt hij, of hij laat ze kopiëren. De Atlas Van Gijn behoort, samen met de Atlas van Stolk en de Atlas van Muller, tot de drie belangrijkste prentenatlassen van Nederland.
Van Gijns prentenverzameling bestaat uit twee deelverzamelingen: de Dordracum Illustratum – de Dordtse prentenatlas – en de Historia Batava Illustrata, een prentenatlas met historische afbeeldingen over Nederland.